想測(cè)一株菌的完成圖，基因組大概3Mb，GC含量46%
測(cè)序公司說可以用二代HiSeq先測(cè)，然后用一代、三代補(bǔ)Gap；
或者用二代測(cè)完精細(xì)圖，自己補(bǔ)Gap。價(jià)格便宜但是時(shí)間耗費(fèi)要長(zhǎng)一些。
最近看了一些資料，三代讀長(zhǎng)更長(zhǎng)，測(cè)完拼裝，不用補(bǔ)Gap的樣子。覆蓋度也能達(dá)到100×，“感覺”好像更好一些。
如果價(jià)格差不多的情況下，三代和二代哪個(gè)更適合用來測(cè)細(xì)菌完成圖呢。
請(qǐng)各位大神賜教～～